Details for gene set PROTEIN

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	PROTEIN_TRANSPORT
Enrichment Score (ES)	0.17184894
Normalized Enrichment Score (NES)	2.414075
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.0046847765
FWER p-Value	0.089

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	LTBP2	751	0.639	-0.0342	Yes
2	AP1M2	878	0.576	-0.0345	Yes
3	TNF	1751	0.302	-0.0752	Yes
4	ABCG1	1755	0.301	-0.0688	Yes
5	KIF13B	1776	0.296	-0.0634	Yes
6	SCG5	1850	0.285	-0.0609	Yes
7	DUSP16	2100	0.251	-0.0679	Yes
8	TPR	2224	0.237	-0.0680	Yes
9	ZFYVE16	2632	0.199	-0.0836	Yes
10	F2	2682	0.195	-0.0797	Yes
11	GABARAP	2702	0.193	-0.0743	Yes
12	NF1	3060	0.169	-0.0871	Yes
13	SYNRG	3123	0.165	-0.0840	Yes
14	CEP290	3293	0.155	-0.0866	Yes
15	TRPS1	3468	0.147	-0.0895	Yes
16	FYB	3497	0.145	-0.0846	Yes
17	RAB3GAP2	3520	0.144	-0.0793	Yes
18	PEX12	3536	0.144	-0.0736	Yes
19	RANBP2	3549	0.143	-0.0677	Yes
20	MYO6	3620	0.139	-0.0650	Yes
21	CDH1	3669	0.137	-0.0611	Yes
22	NLGN1	3765	0.133	-0.0598	Yes
23	MFN2	3841	0.129	-0.0573	Yes
24	KPNA2	3854	0.128	-0.0515	Yes
25	GSK3B	3855	0.128	-0.0450	Yes
26	F2R	3970	0.124	-0.0447	Yes
27	XPO7	4179	0.115	-0.0494	Yes
28	TOMM20	4311	0.111	-0.0500	Yes
29	APBA1	4342	0.110	-0.0452	Yes
30	STAP1	4716	0.097	-0.0589	Yes
31	CALR	4768	0.095	-0.0551	Yes
32	ZDHHC17	4785	0.095	-0.0495	Yes
33	APPBP2	4866	0.092	-0.0473	Yes
34	NCKIPSD	4929	0.091	-0.0442	Yes
35	IPO5	5029	0.088	-0.0431	Yes
36	HPS4	5223	0.082	-0.0470	Yes
37	AKT1	5405	0.078	-0.0503	Yes
38	GLI3	5757	0.068	-0.0628	Yes
39	CEP57	5838	0.066	-0.0607	Yes
40	TIMM17B	5858	0.066	-0.0552	Yes
41	VPS45	5913	0.064	-0.0516	Yes
42	SEC62	6161	0.059	-0.0585	Yes
43	ERP29	6168	0.058	-0.0523	Yes
44	RTP4	6267	0.056	-0.0511	Yes
45	SEC23IP	6391	0.053	-0.0513	Yes
46	RERE	6425	0.052	-0.0466	Yes
47	DERL1	6457	0.051	-0.0418	Yes
48	NPM1	6508	0.050	-0.0380	Yes
49	KPNA4	6605	0.048	-0.0367	Yes
50	UHMK1	6698	0.046	-0.0352	Yes
51	BARD1	6792	0.044	-0.0337	Yes
52	OPTN	6806	0.044	-0.0279	Yes
53	ZFYVE9	6810	0.044	-0.0216	Yes
54	KPNA5	6823	0.043	-0.0158	Yes
55	MCM3AP	6835	0.043	-0.0099	Yes
56	NUP214	6939	0.041	-0.0089	Yes
57	PEX19	6988	0.040	-0.0050	Yes
58	TRAK1	7060	0.038	-0.0024	Yes
59	CBLB	7063	0.038	0.0040	Yes
60	PEX1	7066	0.038	0.0104	Yes
61	ARCN1	7134	0.037	0.0132	Yes
62	VCP	7136	0.036	0.0197	Yes
63	ICMT	7189	0.035	0.0234	Yes
64	TGFB1	7321	0.033	0.0228	Yes
65	NUP205	7472	0.029	0.0211	Yes
66	TIMM17A	7512	0.029	0.0255	Yes
67	AP3M1	7564	0.027	0.0293	Yes
68	TNPO1	7595	0.027	0.0341	Yes
69	RPL11	7674	0.025	0.0364	Yes
70	PDIA3	7706	0.025	0.0412	Yes
71	TRPC4AP	7830	0.023	0.0411	Yes
72	KPNA1	7844	0.022	0.0468	Yes
73	NUPL2	7875	0.022	0.0517	Yes
74	ARFIP1	7889	0.021	0.0575	Yes
75	TRAM1	7905	0.021	0.0632	Yes
76	RPAIN	7943	0.020	0.0677	Yes
77	XPO6	7979	0.020	0.0723	Yes
78	KPNB1	7983	0.019	0.0786	Yes
79	ATG4C	8029	0.019	0.0827	Yes
80	AP1G1	8083	0.018	0.0863	Yes
81	FLNA	8164	0.016	0.0885	Yes
82	AP3B1	8177	0.016	0.0943	Yes
83	PPIH	8284	0.013	0.0951	Yes
84	PEX26	8457	0.010	0.0922	Yes
85	SEC63	8487	0.009	0.0972	Yes
86	TRNT1	8577	0.007	0.0988	Yes
87	STRADA	8599	0.007	0.1042	Yes
88	COG7	8669	0.005	0.1070	Yes
89	AIP	8770	0.004	0.1080	Yes
90	PEX13	8802	0.003	0.1129	Yes
91	TLK1	8868	0.002	0.1158	Yes
92	CTSA	8872	0.002	0.1222	Yes
93	MXI1	9070	-0.002	0.1180	Yes
94	PPT1	9515	-0.011	0.1005	Yes
95	AP3S2	9607	-0.013	0.1020	Yes
96	YWHAH	9617	-0.013	0.1080	Yes
97	PEX10	9811	-0.017	0.1041	Yes
98	MIPEP	9968	-0.020	0.1021	Yes
99	CDC37	10124	-0.023	0.1002	Yes
100	PEX7	10240	-0.025	0.1005	Yes
101	SNAPIN	10301	-0.026	0.1038	Yes
102	FAF1	10352	-0.027	0.1075	Yes
103	NOP58	10369	-0.027	0.1132	Yes
104	KPNA6	10442	-0.029	0.1158	Yes
105	KLHL2	10614	-0.032	0.1130	Yes
106	PEX3	10646	-0.033	0.1178	Yes
107	SSR2	10769	-0.036	0.1177	Yes
108	TAP2	10798	-0.036	0.1227	Yes
109	TOMM34	10891	-0.039	0.1242	Yes
110	MDFI	10987	-0.041	0.1256	Yes
111	TIMM44	11124	-0.045	0.1247	Yes
112	PTTG1IP	11130	-0.045	0.1309	Yes
113	KDELR1	11137	-0.045	0.1371	Yes
114	NFKBIL1	11305	-0.049	0.1345	Yes
115	TOMM22	11477	-0.053	0.1318	Yes
116	EIF5A	11739	-0.059	0.1241	Yes
117	LMAN2L	11751	-0.059	0.1300	Yes
118	TRIP6	11788	-0.060	0.1346	Yes
119	DERL2	11897	-0.063	0.1352	Yes
120	SSR1	12003	-0.065	0.1360	Yes
121	AP3D1	12067	-0.067	0.1391	Yes
122	KPNA3	12180	-0.069	0.1396	Yes
123	COG2	12527	-0.078	0.1273	Yes
124	ATG4B	12529	-0.078	0.1338	Yes
125	GGA1	12628	-0.081	0.1350	Yes
126	PEX16	12666	-0.082	0.1394	Yes
127	TAMM41	12899	-0.089	0.1334	Yes
128	TSPO	12900	-0.089	0.1399	Yes
129	PEX14	12932	-0.090	0.1447	Yes
130	NAGPA	12952	-0.090	0.1502	Yes
131	TIMM23	13005	-0.092	0.1538	Yes
132	SMAD3	13263	-0.101	0.1464	Yes
133	HOMER3	13276	-0.101	0.1523	Yes
134	KDELR2	13456	-0.107	0.1491	Yes
135	PPP1R10	13549	-0.110	0.1506	Yes
136	MYH9	13614	-0.112	0.1536	Yes
137	NLRP3	13686	-0.115	0.1563	Yes
138	CD74	13713	-0.116	0.1614	Yes
139	PEX6	13760	-0.118	0.1654	Yes
140	RPGR	13776	-0.119	0.1710	Yes
141	ATG4A	13882	-0.123	0.1718	Yes
142	ATG4D	14347	-0.147	0.1532	No
143	TONSL	14516	-0.154	0.1506	No
144	NFKBIE	14967	-0.183	0.1328	No
145	STRADB	15221	-0.202	0.1256	No
146	BCL3	15301	-0.210	0.1278	No
147	TNFSF14	15946	-0.281	0.0994	No
148	CD3G	16146	-0.308	0.0952	No
149	BCL6	16262	-0.328	0.0954	No
150	AGXT	16838	-0.465	0.0708	No
151	RTP3	16910	-0.482	0.0734	No
152	LRP1B	16924	-0.484	0.0792	No
153	ANGPTL3	17208	-0.583	0.0704	No
154	NLRP12	17544	-0.764	0.0588	No